More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1743 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 357 aa  729    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  94.12 
 
 		 357 aa  692    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  78.59 
 
 		 356 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  77.75 
 
 		 356 aa  579  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  77.56 
 
 		 362 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  75.49 
 
 		 382 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  75.49 
 
 		 382 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  75.21 
 
 		 382 aa  558  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  73.64 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  73.35 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  73.64 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 		 356 aa  534  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  72.65 
 
 		 359 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  72.78 
 
 		 353 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  72.93 
 
 		 359 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  72.93 
 
 		 359 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 		 356 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  72.93 
 
 		 359 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  72.93 
 
 		 359 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  61.52 
 
 		 360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  59.77 
 
 		 346 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  59.48 
 
 		 346 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  58.62 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  56.9 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  52.81 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  49.27 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  51.62 
 
 		 371 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  47.85 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  47.58 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  47.29 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  47.29 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  45.79 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  47.16 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  47.01 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  46.02 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  46.49 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  45.94 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  45.66 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  45.66 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  45.38 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  44.09 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  42.66 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  43.35 
 
 		 351 aa  292  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 		 374 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 		 365 aa  255  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 		 354 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  36.65 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  45.01 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  38.87 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  35.31 
 
 		 351 aa  235  7e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.9 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.31 
 
 		 373 aa  212  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  34.23 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  32.99 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  36.17 
 
 		 364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  37.32 
 
 		 402 aa  199  9e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  35.56 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 		 370 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  35.08 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.15 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 		 363 aa  172  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.95 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.91 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 		 358 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.36 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  30.62 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  31.15 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.8 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  32.06 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  31.06 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 		 373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  30.93 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  28.82 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  29.82 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  31.25 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  30.53 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>