More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1616 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
352 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  81.45 
 
 
349 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  70.34 
 
 
399 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  73.07 
 
 
396 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  70.62 
 
 
399 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  70.62 
 
 
386 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  72.78 
 
 
391 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  70.34 
 
 
399 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  72.78 
 
 
406 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 
401 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  70.2 
 
 
373 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  70.18 
 
 
356 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  69.88 
 
 
348 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  68.7 
 
 
360 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  66.67 
 
 
351 aa  461  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 
362 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
346 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  53.63 
 
 
346 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  52.37 
 
 
346 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  47.85 
 
 
357 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  51.06 
 
 
346 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  48.99 
 
 
353 aa  314  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  48.41 
 
 
356 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  47.54 
 
 
357 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  48.12 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 
382 aa  308  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  47.54 
 
 
359 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  47.83 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  48.28 
 
 
356 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  47.25 
 
 
359 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  47.25 
 
 
359 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  47.25 
 
 
359 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  47.99 
 
 
356 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  46.44 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  47.83 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 
359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  47.41 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  47.41 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  47.54 
 
 
356 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  47.41 
 
 
356 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  47.38 
 
 
362 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  48.75 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  43.84 
 
 
359 aa  279  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  44.19 
 
 
371 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  41.93 
 
 
368 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  39.2 
 
 
354 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  41.74 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 
365 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  38.07 
 
 
365 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
357 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 
374 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  39.74 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  37.04 
 
 
355 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
351 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.51 
 
 
348 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  31.36 
 
 
351 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
402 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.2 
 
 
358 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  36.33 
 
 
447 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  32.23 
 
 
410 aa  159  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.16 
 
 
344 aa  159  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
368 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.52 
 
 
401 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
358 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
358 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  31.25 
 
 
364 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  27.91 
 
 
357 aa  142  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  31.06 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  30.95 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  32.22 
 
 
358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  30.64 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  31.89 
 
 
356 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  30.53 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
375 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 
371 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 
335 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
357 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  30.48 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  29.24 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  29.16 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  27.59 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
363 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  30.38 
 
 
370 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  29.75 
 
 
356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
360 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  32.98 
 
 
360 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>