More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0312 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
363 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  79.06 
 
 
359 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  79.34 
 
 
359 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  75.49 
 
 
355 aa  557  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  75.21 
 
 
355 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  73.89 
 
 
356 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  74.17 
 
 
357 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  73.61 
 
 
356 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  73.33 
 
 
357 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  73.54 
 
 
355 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  73.33 
 
 
357 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  73.54 
 
 
355 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  73.33 
 
 
357 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  73.33 
 
 
357 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  72.98 
 
 
355 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  72.42 
 
 
371 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  74.58 
 
 
355 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  74.86 
 
 
355 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  72.14 
 
 
355 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  71.87 
 
 
355 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  64.9 
 
 
356 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  64.82 
 
 
353 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  62.57 
 
 
353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  61.9 
 
 
357 aa  448  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  62.4 
 
 
354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  60.78 
 
 
353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  59.44 
 
 
357 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  59.22 
 
 
356 aa  434  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  60.89 
 
 
352 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  57.85 
 
 
369 aa  418  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  59.6 
 
 
351 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  59.6 
 
 
351 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  59.27 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 
348 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  56.58 
 
 
350 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  57.7 
 
 
350 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  56.3 
 
 
350 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  57.06 
 
 
348 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 
348 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  58.66 
 
 
356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  56.02 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  56.82 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  56.21 
 
 
351 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
356 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  58.94 
 
 
351 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  51.67 
 
 
353 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  55.4 
 
 
355 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 
355 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  52.66 
 
 
351 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
355 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  52.92 
 
 
353 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  50.42 
 
 
367 aa  359  4e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  51.65 
 
 
377 aa  359  4e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  51.65 
 
 
377 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  48.02 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  48.88 
 
 
349 aa  345  8e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  47.21 
 
 
355 aa  342  9e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  44.29 
 
 
354 aa  324  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  44.25 
 
 
356 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  39 
 
 
350 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  41.97 
 
 
358 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  41.67 
 
 
350 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  40.46 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
350 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
348 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
348 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  41.31 
 
 
350 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  41.31 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  40.46 
 
 
347 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  35.61 
 
 
365 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 
364 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  38.12 
 
 
358 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.64 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
360 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  30.98 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  28.81 
 
 
358 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 
365 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  34.87 
 
 
374 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  35.13 
 
 
362 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.99 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
364 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
365 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
373 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  31.48 
 
 
365 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.6 
 
 
369 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  31.39 
 
 
365 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  31.28 
 
 
371 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
359 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
359 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  34.34 
 
 
369 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>