More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1901 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
377 aa  769    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  93.9 
 
 
377 aa  725    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  73.77 
 
 
367 aa  548  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 
348 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  53.31 
 
 
356 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 
348 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  55.31 
 
 
348 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 
350 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  53.19 
 
 
350 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  54.19 
 
 
348 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  54.97 
 
 
351 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  55.04 
 
 
353 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  54.7 
 
 
351 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  53.35 
 
 
350 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  53.07 
 
 
356 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  52.89 
 
 
350 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  52.91 
 
 
355 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  54.02 
 
 
351 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  53.61 
 
 
354 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  52.42 
 
 
369 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  51.79 
 
 
355 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  51.79 
 
 
355 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  54.12 
 
 
357 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  55.03 
 
 
351 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  50.82 
 
 
371 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  50.69 
 
 
355 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  51.38 
 
 
353 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  52.75 
 
 
353 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  52.6 
 
 
357 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  52.08 
 
 
359 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  51.8 
 
 
355 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  52.08 
 
 
355 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  52.09 
 
 
359 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  50.68 
 
 
357 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  50.69 
 
 
355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  51.1 
 
 
353 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
356 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
357 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
357 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
357 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
357 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
356 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  50.41 
 
 
357 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  52.35 
 
 
356 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  50.97 
 
 
356 aa  348  8e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  51.8 
 
 
355 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  46.94 
 
 
353 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  51.65 
 
 
363 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  51.52 
 
 
355 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  50.69 
 
 
355 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  51.38 
 
 
355 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  50.27 
 
 
362 aa  342  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  51.62 
 
 
370 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 
356 aa  333  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  45.71 
 
 
354 aa  333  4e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  46.53 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  46.26 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  42.22 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  41.11 
 
 
349 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  38.48 
 
 
350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  38.72 
 
 
356 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 
348 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 
348 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 
350 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
350 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  38.4 
 
 
347 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
350 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
350 aa  222  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  40.4 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
350 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  35.82 
 
 
354 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  37.92 
 
 
358 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  36.93 
 
 
347 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
358 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  31.79 
 
 
364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  31.08 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.98 
 
 
370 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  34 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
365 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 
360 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 
380 aa  161  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.9 
 
 
358 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.87 
 
 
351 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  32.07 
 
 
380 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  32.41 
 
 
360 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 
371 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
369 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  30.66 
 
 
374 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  31.51 
 
 
365 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  31.11 
 
 
365 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
392 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
386 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  30.96 
 
 
365 aa  156  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
369 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  30.22 
 
 
355 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>