More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0385 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  100 
 
 		 350 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  82.86 
 
 		 350 aa  617  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  76.57 
 
 		 350 aa  585  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  76.29 
 
 		 350 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  69.71 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  72.29 
 
 		 347 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  70 
 
 		 350 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  69.71 
 
 		 350 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  42.73 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  38.22 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  41.74 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  38.86 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  38.97 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  39.02 
 
 		 355 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 		 355 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 		 355 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  40.34 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  37.07 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  39.37 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  36.99 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  39.24 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  39.37 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  35.92 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  36.78 
 
 		 354 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  36.18 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  39.14 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  36.23 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  37.61 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  38.22 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  38.37 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.63 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 		 377 aa  222  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  35.84 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 		 359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  36.1 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  34.68 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  38.22 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 		 350 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  36.52 
 
 		 355 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  35.17 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  35.76 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 		 351 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  34.39 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  33.91 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 		 356 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  33.52 
 
 		 356 aa  182  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.79 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.03 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 		 367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.93 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  32.41 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 360 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  33.92 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 372 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  32.15 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  30.64 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  31.8 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  31.94 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  34.89 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>