More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3099 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 350 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  82.86 
 
 		 350 aa  617  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  78.57 
 
 		 350 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  76.29 
 
 		 350 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  71.43 
 
 		 347 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  73.14 
 
 		 347 aa  507  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  69.71 
 
 		 350 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  69.14 
 
 		 350 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  40.97 
 
 		 348 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  40.97 
 
 		 348 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  41.26 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  42.9 
 
 		 356 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  42.36 
 
 		 364 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  40.97 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  44.38 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  42.07 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  41.38 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  41.38 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  41.09 
 
 		 371 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  40.52 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  43.52 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  41.18 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  41.71 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  42.06 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  41.47 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  41.95 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  40.88 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  41.95 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  40.59 
 
 		 357 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  40.59 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  40.59 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  40.59 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  40.59 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  42.94 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  40.96 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  40.8 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  41.31 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  37.79 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  40.52 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  38.73 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  37.93 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 		 348 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  36.99 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  39.77 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  40.87 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 		 348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  39.38 
 
 		 351 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  38.79 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  34.67 
 
 		 355 aa  219  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  35.84 
 
 		 350 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  37.93 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  34 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  37.79 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  39.65 
 
 		 356 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  35.9 
 
 		 356 aa  209  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  37.79 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  35.07 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  36.8 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  32.86 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  34.45 
 
 		 356 aa  186  8e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  35.82 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  33.7 
 
 		 383 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.14 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.68 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  35 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.28 
 
 		 362 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  34.47 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  35.84 
 
 		 406 aa  162  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  30.96 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>