More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1006 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  99.14 
 
 		 348 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 348 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  92.82 
 
 		 348 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  97.41 
 
 		 348 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  82.76 
 
 		 350 aa  594  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  83.29 
 
 		 350 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  84.15 
 
 		 350 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  82.76 
 
 		 350 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  80.69 
 
 		 351 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  80.69 
 
 		 351 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  80.46 
 
 		 351 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  67.52 
 
 		 356 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  66.38 
 
 		 354 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  66.29 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  67.53 
 
 		 357 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  66.86 
 
 		 357 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  62.82 
 
 		 369 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  64.1 
 
 		 357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  62.36 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  63.4 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  61.14 
 
 		 355 aa  438  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  60.52 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  63.37 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  61.14 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  60.86 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  58.86 
 
 		 355 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  58.79 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 		 359 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  58.86 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  58.86 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  58.86 
 
 		 355 aa  417  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  60.81 
 
 		 351 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  59.14 
 
 		 355 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  58.29 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 		 356 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  58.29 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  58.29 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  58.29 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  58.79 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  59.14 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  56.82 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  58.62 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  55.71 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  54.46 
 
 		 353 aa  394  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  53.6 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  50.15 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  53.57 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  53.63 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  47.32 
 
 		 355 aa  345  8.999999999999999e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  47.35 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  47.37 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  43.97 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  42.61 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  43.2 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  36.99 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  38.37 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  39.65 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  36.23 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 		 350 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  35.82 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 		 358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  34.96 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  37.96 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.14 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.2 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  34.03 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.54 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.11 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.08 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  33.15 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  30.3 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>