More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1113 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 357 aa  725    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  69.3 
 
 		 356 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  67.53 
 
 		 348 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  67.62 
 
 		 357 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  66.29 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  64.33 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  66.67 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  67.53 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  67.72 
 
 		 351 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  67.53 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  66.67 
 
 		 348 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  64.57 
 
 		 350 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  64.86 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  64.2 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  66 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  66.28 
 
 		 351 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  64.87 
 
 		 353 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  66.1 
 
 		 351 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  63.38 
 
 		 355 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  62.08 
 
 		 356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  62.61 
 
 		 357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  62.32 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  62.32 
 
 		 357 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  62.08 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  62.32 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  61.13 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  61.13 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  62.32 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  62.15 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  60.56 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  61.52 
 
 		 359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  61.65 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  62.08 
 
 		 359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  64 
 
 		 356 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  61.3 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  61.02 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  59.44 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  59.44 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  60.67 
 
 		 370 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  60.62 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  61.13 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  59.6 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  59.45 
 
 		 369 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  59.32 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  57.83 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  59.77 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  60.97 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  52.12 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  56.25 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  51.57 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  56.62 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  55.04 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  52.41 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  51.7 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  53.17 
 
 		 377 aa  360  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  52.6 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  48.72 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  47.03 
 
 		 356 aa  351  8.999999999999999e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  44.63 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  46.11 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  44.06 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  41.81 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  39.61 
 
 		 350 aa  236  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  42.05 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  39.38 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  35.98 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  39.53 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 		 348 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 		 348 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  36.49 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  35.59 
 
 		 354 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  34.57 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.36 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.45 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.7 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 		 392 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  31.48 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.33 
 
 		 351 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.31 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 		 370 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  32.55 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  31.28 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  30.75 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  31.03 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  31.03 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  33.79 
 
 		 371 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  31.41 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>