More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2723 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  90.7 
 
 
355 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  91.83 
 
 
355 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  92.96 
 
 
371 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
355 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  93.24 
 
 
355 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  97.75 
 
 
355 aa  688    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  93.24 
 
 
355 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  82.82 
 
 
355 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  81.97 
 
 
356 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  81.69 
 
 
356 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  81.41 
 
 
357 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  81.41 
 
 
357 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  81.41 
 
 
357 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  81.41 
 
 
357 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  81.07 
 
 
355 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  81.41 
 
 
357 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  81.07 
 
 
355 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  72.96 
 
 
359 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  71.87 
 
 
363 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  72.11 
 
 
359 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  66.76 
 
 
357 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  65.45 
 
 
356 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  66.38 
 
 
357 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  61.52 
 
 
353 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  61.02 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  58.47 
 
 
356 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  58.87 
 
 
354 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  58.95 
 
 
369 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
353 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  60.62 
 
 
351 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  58.29 
 
 
348 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  60.62 
 
 
351 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
353 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  56.94 
 
 
350 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 
348 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  59.43 
 
 
348 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  56.94 
 
 
350 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  57.71 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 
350 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  58.64 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 
350 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  56.02 
 
 
355 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 
351 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  58.82 
 
 
370 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  52.11 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  57.3 
 
 
362 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  59.26 
 
 
356 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  55.34 
 
 
353 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 
356 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  52.66 
 
 
367 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 
355 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  51.8 
 
 
377 aa  368  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  51.52 
 
 
377 aa  361  9e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  52.29 
 
 
351 aa  351  8.999999999999999e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  46.29 
 
 
356 aa  339  4e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  44.63 
 
 
355 aa  325  6e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  43.1 
 
 
354 aa  322  6e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  42.33 
 
 
349 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  40.46 
 
 
350 aa  281  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  44.38 
 
 
356 aa  278  7e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  41.95 
 
 
350 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  41.09 
 
 
350 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  43.59 
 
 
358 aa  249  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
350 aa  245  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  38.51 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  39.37 
 
 
350 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
348 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
348 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  42.45 
 
 
350 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  42.45 
 
 
350 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  39.08 
 
 
347 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  38.04 
 
 
354 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 
347 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  37.6 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
365 aa  196  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 
370 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
357 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  29.81 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
377 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  35.97 
 
 
369 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
374 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 
365 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  29.83 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 
362 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  36.75 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  36.75 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  36.75 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  33.6 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  33.53 
 
 
373 aa  162  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.41 
 
 
365 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  33.91 
 
 
357 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
363 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 
360 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 
365 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  37.9 
 
 
373 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
366 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>