More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3529 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
349 aa  716    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  52.17 
 
 
356 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  53.31 
 
 
353 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  51.29 
 
 
355 aa  371  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  48.7 
 
 
355 aa  358  6e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  48.13 
 
 
356 aa  343  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  50.58 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  48.88 
 
 
363 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  46.31 
 
 
356 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  44.96 
 
 
351 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  47.01 
 
 
359 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  47.37 
 
 
348 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  47.66 
 
 
348 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  47.37 
 
 
348 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  45.85 
 
 
352 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  46.11 
 
 
357 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  46.44 
 
 
359 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  46.26 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  47.08 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  47.58 
 
 
353 aa  325  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  45.85 
 
 
353 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  44.41 
 
 
353 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  45.38 
 
 
350 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  45.66 
 
 
350 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  45.09 
 
 
350 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  44.6 
 
 
355 aa  315  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  44.77 
 
 
353 aa  315  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  43.75 
 
 
355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  44.94 
 
 
369 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  44.93 
 
 
350 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  43.47 
 
 
357 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  45.67 
 
 
351 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
357 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
356 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
356 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
357 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
357 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
357 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  44.16 
 
 
362 aa  308  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  45.07 
 
 
350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  46.2 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  42.9 
 
 
355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  43.55 
 
 
351 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  41.71 
 
 
357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  42.25 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  42.05 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  42.05 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  44.44 
 
 
351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  42.05 
 
 
371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  42.33 
 
 
355 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  43.8 
 
 
356 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  43.75 
 
 
355 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  42.61 
 
 
355 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
355 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  42.33 
 
 
355 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  41.11 
 
 
377 aa  297  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  43.49 
 
 
356 aa  295  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  41.93 
 
 
357 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
355 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  42.36 
 
 
370 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  41.21 
 
 
377 aa  290  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  40.54 
 
 
356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  34.2 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  34.2 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  36.92 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 
347 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
350 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
350 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
350 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
350 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  32.3 
 
 
358 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  32.86 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
350 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
347 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  30.43 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  29.86 
 
 
364 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  29.69 
 
 
371 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 
358 aa  153  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  29.53 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  27.65 
 
 
358 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  29.66 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 
335 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  29.27 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  28.25 
 
 
352 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 
358 aa  136  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1623  aminotransferase class I and II  28.88 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  28.21 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 
362 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  27.22 
 
 
362 aa  133  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  29.44 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  28 
 
 
358 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  29.06 
 
 
355 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 
351 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>