More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2959 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
374 aa  743    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  69.25 
 
 
380 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  72.43 
 
 
377 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  72.43 
 
 
377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  72.43 
 
 
377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3612  histidinol-phosphate aminotransferase  71.63 
 
 
377 aa  474  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129757  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  71.9 
 
 
373 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.696784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  68.51 
 
 
366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  68.35 
 
 
374 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2024  histidinol-phosphate aminotransferase  64.46 
 
 
374 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5721  histidinol-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 
383 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  62.22 
 
 
362 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  60.45 
 
 
360 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  61.47 
 
 
356 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  63.14 
 
 
366 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  56.3 
 
 
377 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  55.59 
 
 
369 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  56.75 
 
 
397 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  59.17 
 
 
358 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  55.49 
 
 
375 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  59.77 
 
 
361 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
367 aa  364  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  58.33 
 
 
358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  56.11 
 
 
370 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  53.87 
 
 
387 aa  353  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  55.49 
 
 
379 aa  352  7e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  53.82 
 
 
453 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 
378 aa  344  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1470  histidinol-phosphate aminotransferase  52.11 
 
 
372 aa  342  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0168842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  51.41 
 
 
372 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  53.71 
 
 
406 aa  331  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  50.97 
 
 
386 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  53.39 
 
 
362 aa  329  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  51.63 
 
 
373 aa  327  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22550  histidinol phosphate aminotransferase  50.96 
 
 
380 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0153  histidinol-phosphate aminotransferase  47.96 
 
 
386 aa  311  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.936384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
380 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
368 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.91 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  40.76 
 
 
344 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
363 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  35.59 
 
 
363 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 
359 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 
359 aa  170  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.7 
 
 
358 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
357 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  35.21 
 
 
360 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  37.09 
 
 
391 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
357 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  38.16 
 
 
365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.11 
 
 
373 aa  162  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  34.99 
 
 
365 aa  162  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 
357 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
356 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
356 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
357 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
357 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
357 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
357 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
350 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
357 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 
355 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
359 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
355 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
355 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  36.96 
 
 
355 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  34.87 
 
 
363 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  30.98 
 
 
355 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
350 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 
359 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
355 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  34.45 
 
 
366 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  33.96 
 
 
370 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  36.1 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  35.73 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  36.1 
 
 
371 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
355 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
365 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 
357 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  29.25 
 
 
349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 
370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
363 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 
369 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.73 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  29.32 
 
 
358 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  33.89 
 
 
366 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 
362 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 
355 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 
348 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 
348 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
360 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 
357 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  32.69 
 
 
356 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  29.89 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>