More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0872 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 350 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  84.29 
 
 		 350 aa  614  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  84 
 
 		 350 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  83.29 
 
 		 348 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  83.29 
 
 		 348 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  83.29 
 
 		 348 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  82.71 
 
 		 348 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  81.71 
 
 		 350 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  80.12 
 
 		 351 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  78.96 
 
 		 351 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  78 
 
 		 351 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  68.36 
 
 		 356 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  67.14 
 
 		 353 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  64.96 
 
 		 354 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  64.57 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  64 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  62.57 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  63.28 
 
 		 357 aa  455  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  61.41 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  61.43 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  60.91 
 
 		 355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  63.19 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  58.86 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  58.92 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  59.77 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  56.57 
 
 		 353 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  59.21 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  58.07 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  57.79 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  59.49 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  57.79 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  59.43 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  58.36 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  57.14 
 
 		 353 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  56.66 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  56.66 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  56.66 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  56.3 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  55.81 
 
 		 353 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  55.21 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  57.76 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  52 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  53.03 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  53.19 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  52 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  52.63 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  45.14 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  44.16 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  45.07 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  42.27 
 
 		 350 aa  291  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  40.97 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  38.26 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  39.88 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  36.08 
 
 		 350 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  37.91 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  35.63 
 
 		 350 aa  225  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  35.31 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  35.31 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.78 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  34.54 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  38.25 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  37.84 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  35.07 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  35.07 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.51 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.64 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  31.84 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  32.02 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  32.03 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  34.31 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.46 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  35.23 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>