More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3368 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  94.93 
 
 		 355 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 355 aa  721    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  83.33 
 
 		 355 aa  607  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  81.92 
 
 		 355 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  81.92 
 
 		 355 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  82.2 
 
 		 355 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  80.79 
 
 		 371 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  81.07 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  81.64 
 
 		 355 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  79.66 
 
 		 355 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  78.81 
 
 		 356 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  78.25 
 
 		 357 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  78.25 
 
 		 357 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  78.53 
 
 		 356 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  78.25 
 
 		 357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  78.25 
 
 		 357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  78.25 
 
 		 357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  74.86 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  73.16 
 
 		 359 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  72.11 
 
 		 359 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  67.23 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  64.31 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  64.25 
 
 		 357 aa  461  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  63.17 
 
 		 351 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  59.55 
 
 		 353 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  61.76 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  58.92 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  60.29 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  59.32 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  58.92 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  59.43 
 
 		 348 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  58.03 
 
 		 356 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  58.92 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  59.21 
 
 		 351 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  58.36 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  59.1 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  58.94 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  59.44 
 
 		 353 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 		 351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  61.25 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  58.87 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  57.66 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  56.78 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  53.93 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  52.39 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  51.38 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  50.99 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 		 377 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  46.44 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  45.07 
 
 		 355 aa  333  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  43.26 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  43.75 
 
 		 349 aa  305  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  40.75 
 
 		 350 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  43.6 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  44.6 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  43.52 
 
 		 350 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  39.5 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  42.77 
 
 		 350 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 		 350 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  39.6 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  41.33 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  41.33 
 
 		 350 aa  235  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  38.9 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  36.96 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  38.4 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.88 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  37.97 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.14 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  34.03 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  35.25 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  35.34 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.43 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  37.1 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  34.39 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.31 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>