More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
374 aa  742    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  67.97 
 
 
374 aa  495  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  68.16 
 
 
380 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  69.55 
 
 
366 aa  484  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5721  histidinol-phosphate aminotransferase  77.5 
 
 
383 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  70.79 
 
 
377 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  71.07 
 
 
377 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  71.07 
 
 
377 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3612  histidinol-phosphate aminotransferase  69.91 
 
 
377 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129757  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  68.48 
 
 
373 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.696784  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2024  histidinol-phosphate aminotransferase  62.95 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  62.67 
 
 
362 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  63.97 
 
 
360 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  62.36 
 
 
377 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  62.61 
 
 
356 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  63.76 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  60.78 
 
 
397 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  63.76 
 
 
366 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  58.66 
 
 
369 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  58.12 
 
 
453 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  56.99 
 
 
375 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  59.61 
 
 
358 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  62.54 
 
 
367 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  55.08 
 
 
387 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  58.06 
 
 
379 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  56.87 
 
 
378 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  56.68 
 
 
373 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  59.05 
 
 
358 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  53.19 
 
 
372 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1470  histidinol-phosphate aminotransferase  53.5 
 
 
372 aa  359  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0168842  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  56.79 
 
 
370 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  57.83 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  52.85 
 
 
386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  55.71 
 
 
362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22550  histidinol phosphate aminotransferase  54.08 
 
 
380 aa  342  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0153  histidinol-phosphate aminotransferase  47.91 
 
 
386 aa  321  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.936384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 
380 aa  318  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  40.39 
 
 
371 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  39.49 
 
 
363 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 
368 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  44.41 
 
 
344 aa  202  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 
351 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 
363 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  37.39 
 
 
360 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  39 
 
 
365 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  38.94 
 
 
365 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 
355 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  38.83 
 
 
366 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.2 
 
 
358 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.26 
 
 
373 aa  183  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  36.48 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
370 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
359 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
359 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 
357 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
357 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
358 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  34.99 
 
 
363 aa  176  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  36.78 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
369 aa  173  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 
350 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
357 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  32.79 
 
 
348 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 
374 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  35.97 
 
 
374 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.42 
 
 
355 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
351 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 
356 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  35.41 
 
 
360 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
357 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
357 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  36.96 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 
364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  36.21 
 
 
356 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
349 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  34.88 
 
 
367 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 
356 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 
365 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  34.75 
 
 
375 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
356 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.78 
 
 
373 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
381 aa  159  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  37.39 
 
 
362 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 
371 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 
356 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
355 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 
357 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
355 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 
355 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>