More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3195 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
358 aa  707    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  90.78 
 
 
358 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  66.95 
 
 
362 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  71.01 
 
 
361 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  64.77 
 
 
356 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  64.1 
 
 
360 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  61.98 
 
 
377 aa  424  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  63.1 
 
 
369 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  65.64 
 
 
366 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  64.35 
 
 
397 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  62.74 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  59.17 
 
 
374 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1470  histidinol-phosphate aminotransferase  60.5 
 
 
372 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0168842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  60.39 
 
 
372 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  60.86 
 
 
453 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  57.62 
 
 
380 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  62.39 
 
 
367 aa  381  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  59.05 
 
 
374 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  57.92 
 
 
387 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  58.4 
 
 
375 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  58.33 
 
 
379 aa  368  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  57.1 
 
 
378 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  58.92 
 
 
366 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  55.56 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2024  histidinol-phosphate aminotransferase  53.76 
 
 
374 aa  361  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  55.56 
 
 
377 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  57.34 
 
 
362 aa  361  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  55.56 
 
 
377 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  57.18 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3612  histidinol-phosphate aminotransferase  56.13 
 
 
377 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129757  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  58.17 
 
 
406 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  55.27 
 
 
373 aa  352  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.696784  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 
386 aa  340  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 
380 aa  339  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5721  histidinol-phosphate aminotransferase  59.44 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22550  histidinol phosphate aminotransferase  53.7 
 
 
380 aa  332  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0153  histidinol-phosphate aminotransferase  47.61 
 
 
386 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.936384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
371 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
368 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
363 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
357 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
351 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  39.15 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  39.29 
 
 
365 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  41.59 
 
 
344 aa  175  8e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.44 
 
 
358 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
365 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 
358 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 
360 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  34.55 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.98 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  36.01 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  35.12 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
358 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  34.83 
 
 
357 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  40.76 
 
 
379 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
350 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  29.68 
 
 
350 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
349 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
365 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.22 
 
 
369 aa  160  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  34.75 
 
 
369 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  32.22 
 
 
373 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  34.09 
 
 
359 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  34.09 
 
 
359 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
357 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 
383 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.4 
 
 
360 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  35.99 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.26 
 
 
355 aa  155  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
353 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  34.22 
 
 
374 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
350 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
355 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
364 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
382 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  34.81 
 
 
350 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  27.37 
 
 
351 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.4 
 
 
356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
385 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
356 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  35.91 
 
 
374 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.39 
 
 
355 aa  152  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
356 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  34.97 
 
 
367 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
365 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
382 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  35.05 
 
 
370 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  34.49 
 
 
374 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  34.62 
 
 
370 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
347 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
371 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 
362 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 
357 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  35.75 
 
 
355 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
370 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
360 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>