More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5721 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5721  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
383 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  77.5 
 
 
374 aa  521  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  69.51 
 
 
374 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  71.31 
 
 
377 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  71.31 
 
 
377 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  71.31 
 
 
377 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  68.23 
 
 
380 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  70.56 
 
 
366 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3612  histidinol-phosphate aminotransferase  70.92 
 
 
377 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129757  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  70.11 
 
 
373 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.696784  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2024  histidinol-phosphate aminotransferase  61.37 
 
 
374 aa  448  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  64.33 
 
 
362 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  64.04 
 
 
356 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  67.42 
 
 
366 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  62.96 
 
 
360 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  61.81 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  60.72 
 
 
369 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  59.15 
 
 
397 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  61.84 
 
 
361 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  57.83 
 
 
453 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  56.87 
 
 
370 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  56.4 
 
 
387 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  62.25 
 
 
367 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  60.55 
 
 
358 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  57.42 
 
 
375 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  60.82 
 
 
358 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  56.23 
 
 
362 aa  361  9e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 
378 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  58.97 
 
 
406 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  56.51 
 
 
379 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  55.59 
 
 
373 aa  353  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22550  histidinol phosphate aminotransferase  55.83 
 
 
380 aa  348  8e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1470  histidinol-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 
372 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0168842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  53.19 
 
 
372 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  49.6 
 
 
386 aa  329  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0153  histidinol-phosphate aminotransferase  49.87 
 
 
386 aa  328  7e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.936384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  51.82 
 
 
380 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  38.94 
 
 
371 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  38.61 
 
 
368 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.3 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  42.13 
 
 
344 aa  196  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  38.87 
 
 
360 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
363 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 
363 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 
355 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
358 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
357 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  32.7 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  37.83 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  37.77 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 
366 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
366 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  36.23 
 
 
357 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 
357 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.04 
 
 
358 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  34.15 
 
 
350 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  36.87 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
374 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
355 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  28.38 
 
 
351 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
355 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 
360 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 
363 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
360 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
356 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
357 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  34.88 
 
 
362 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
357 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
357 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
357 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
356 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 
379 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
357 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 
374 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
371 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  35.63 
 
 
357 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  36.18 
 
 
362 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 
355 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
369 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
377 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 
359 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
355 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 
359 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.98 
 
 
370 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 
374 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
370 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  29.1 
 
 
349 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  34.19 
 
 
375 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
350 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
350 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 
364 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  29.95 
 
 
351 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
348 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
348 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
356 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>