More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3247 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  89.89 
 
 		 366 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 366 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  77.05 
 
 		 374 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  76.67 
 
 		 374 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  76.94 
 
 		 374 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  67.98 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  66.29 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  67.42 
 
 		 356 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  66.57 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  66.57 
 
 		 364 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  67.73 
 
 		 356 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  66.28 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  66.86 
 
 		 356 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  66.57 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  56.16 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  57.87 
 
 		 363 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  55.49 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  57.18 
 
 		 375 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  57.7 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  56.3 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  53.76 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  52.6 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  57.98 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  53.33 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  55.12 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  54.52 
 
 		 374 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  53.46 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  49.44 
 
 		 360 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 		 365 aa  319  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  46.8 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 		 359 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 		 359 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 		 355 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.54 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  35.16 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  34.73 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  35.68 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 		 356 aa  196  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 		 349 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 357 aa  192  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  36.5 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  35.24 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 		 363 aa  185  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 		 355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.67 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  31.33 
 
 		 350 aa  179  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  35.15 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  36.67 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  32.5 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.09 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  33.88 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  33.69 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 		 377 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  30.36 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.7 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  32.63 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 		 362 aa  165  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  36.48 
 
 		 374 aa  166  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  37.13 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  30.9 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 		 371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.4 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  35.04 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  31.14 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.83 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4253  aminotransferase class I and II  34.44 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377555  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  27.81 
 
 		 371 aa  159  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  38.27 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>