More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2024 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2024  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
374 aa  754    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  64.46 
 
 
374 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  62.15 
 
 
380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  61.88 
 
 
377 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  62.95 
 
 
374 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  61.88 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  61.88 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  61.26 
 
 
366 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3612  histidinol-phosphate aminotransferase  61.35 
 
 
377 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129757  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  61.52 
 
 
373 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.696784  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5721  histidinol-phosphate aminotransferase  61.37 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  58.52 
 
 
360 aa  391  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  57.98 
 
 
362 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  57.54 
 
 
356 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  53.41 
 
 
377 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  53.99 
 
 
369 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  53.76 
 
 
358 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  55.93 
 
 
366 aa  345  8e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  53.24 
 
 
397 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1470  histidinol-phosphate aminotransferase  50.97 
 
 
372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0168842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  51.1 
 
 
375 aa  339  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  53.48 
 
 
358 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  52.65 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  52.17 
 
 
453 aa  335  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  53.41 
 
 
362 aa  332  8e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  49.32 
 
 
372 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  55.97 
 
 
367 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  53.31 
 
 
361 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  49.6 
 
 
378 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  52.69 
 
 
379 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
387 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22550  histidinol phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
380 aa  319  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  50.81 
 
 
373 aa  318  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  47.97 
 
 
386 aa  312  6.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 
406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0153  histidinol-phosphate aminotransferase  45.9 
 
 
386 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.936384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 
380 aa  288  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.47 
 
 
351 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  34.16 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.22 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
368 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
344 aa  169  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
360 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
357 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
362 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 
360 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  33.52 
 
 
356 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  31.37 
 
 
355 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
358 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
363 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
370 aa  156  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
365 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  33.24 
 
 
391 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 
350 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  32.78 
 
 
350 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
365 aa  152  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  33.78 
 
 
379 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 
350 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  30.72 
 
 
365 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
366 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  34.21 
 
 
355 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  33.22 
 
 
373 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 
347 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
357 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 
355 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
357 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
357 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
357 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  34.09 
 
 
355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  34.2 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 
355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
359 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
356 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
359 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  31.84 
 
 
369 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  34.72 
 
 
360 aa  146  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
356 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  29.33 
 
 
357 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
357 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  34.4 
 
 
351 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 
350 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 
357 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  33.91 
 
 
364 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
362 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  32.18 
 
 
367 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  33.53 
 
 
358 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  33.53 
 
 
358 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
356 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  34.01 
 
 
371 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  33.53 
 
 
358 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  33.81 
 
 
376 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 
355 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 
366 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  31.9 
 
 
370 aa  143  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  31.21 
 
 
371 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  32.95 
 
 
356 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>