More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3559 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
356 aa  723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  96.91 
 
 
356 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  85.11 
 
 
356 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  81.1 
 
 
357 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  82.27 
 
 
357 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  81.4 
 
 
357 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  80.52 
 
 
356 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  82.27 
 
 
357 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  82.27 
 
 
357 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  80.52 
 
 
364 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  79.65 
 
 
356 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  79.65 
 
 
356 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  79.36 
 
 
356 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  79.65 
 
 
356 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  79.65 
 
 
356 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  81.69 
 
 
357 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  79.65 
 
 
356 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  79.65 
 
 
356 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  69.65 
 
 
374 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  67.53 
 
 
366 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  69.65 
 
 
374 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  66.29 
 
 
366 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  69.08 
 
 
374 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  55.65 
 
 
363 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  56.25 
 
 
371 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  56.25 
 
 
368 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  56.52 
 
 
368 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  54.02 
 
 
358 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  54.86 
 
 
365 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  52.92 
 
 
369 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  54.6 
 
 
370 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  54.78 
 
 
374 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  48.31 
 
 
368 aa  352  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  53.59 
 
 
396 aa  351  8.999999999999999e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  51.57 
 
 
363 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  49.58 
 
 
365 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  46.4 
 
 
360 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  47.16 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  47.73 
 
 
359 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  47.73 
 
 
359 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
365 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  35.23 
 
 
351 aa  226  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
349 aa  211  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
358 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
358 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 
356 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  35.37 
 
 
363 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 
355 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  37.24 
 
 
369 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
357 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  35.91 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
349 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
357 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
371 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  36.83 
 
 
348 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
357 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  34.45 
 
 
350 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  37.8 
 
 
374 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
351 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.39 
 
 
360 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  34.5 
 
 
352 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
350 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
357 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  32.65 
 
 
363 aa  179  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
355 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
365 aa  176  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 
362 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  36.96 
 
 
364 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 
370 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  33.52 
 
 
373 aa  169  9e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  33.73 
 
 
352 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
360 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  27.01 
 
 
357 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.56 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  34.59 
 
 
383 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  36.55 
 
 
371 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.14 
 
 
386 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  29.55 
 
 
371 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 
371 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  29.25 
 
 
371 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
362 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  29.55 
 
 
371 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 
347 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  31.75 
 
 
347 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.74 
 
 
370 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
375 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4253  aminotransferase class I and II  31.53 
 
 
347 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4103  histidinol phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
347 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  33.95 
 
 
373 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 
387 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  36.61 
 
 
371 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 
406 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 
365 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 
365 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
361 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  32.02 
 
 
369 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>