More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3026 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
397 aa  789    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  81.79 
 
 
453 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  64.34 
 
 
369 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  63.91 
 
 
362 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  63.16 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  62.13 
 
 
377 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  63.03 
 
 
360 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  65 
 
 
366 aa  411  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  66.01 
 
 
361 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  65.46 
 
 
358 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  64.07 
 
 
358 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  62.57 
 
 
367 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  55.2 
 
 
380 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3078  histidinol-phosphate aminotransferase  58.1 
 
 
377 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3062  histidinol-phosphate aminotransferase  58.1 
 
 
377 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.649839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3121  histidinol-phosphate aminotransferase  58.1 
 
 
377 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  61.06 
 
 
374 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  60.28 
 
 
362 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  59.83 
 
 
379 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  57.49 
 
 
387 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  61.14 
 
 
373 aa  381  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1470  histidinol-phosphate aminotransferase  58.01 
 
 
372 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0168842  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3612  histidinol-phosphate aminotransferase  58.29 
 
 
377 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129757  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  56.75 
 
 
374 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  57.14 
 
 
373 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.696784  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  56.79 
 
 
378 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  58.24 
 
 
375 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  57.1 
 
 
372 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  58.47 
 
 
366 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  56.99 
 
 
370 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22550  histidinol phosphate aminotransferase  57.69 
 
 
380 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  54.74 
 
 
386 aa  361  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  57.43 
 
 
406 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
380 aa  354  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2024  histidinol-phosphate aminotransferase  53.8 
 
 
374 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5721  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
383 aa  345  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0153  histidinol-phosphate aminotransferase  48.28 
 
 
386 aa  329  4e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.936384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  38.57 
 
 
371 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  43.34 
 
 
344 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  36.9 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
363 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.22 
 
 
351 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.95 
 
 
370 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 
363 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
360 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 
365 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  37.03 
 
 
369 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
355 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.81 
 
 
358 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 
357 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
358 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  35.77 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
350 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 
357 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 
350 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  37.36 
 
 
353 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  34.58 
 
 
374 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
371 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
347 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
374 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 
356 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 
374 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  35.62 
 
 
355 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  35.62 
 
 
355 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 
357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 
357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  34.6 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 
357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 
357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  35.85 
 
 
356 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  34.43 
 
 
366 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  35.85 
 
 
357 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
366 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  37.06 
 
 
369 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
374 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  28.21 
 
 
349 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
357 aa  152  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 
371 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  35.04 
 
 
355 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
348 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
348 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
362 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 
370 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  38.14 
 
 
360 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  35.04 
 
 
357 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
350 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 
369 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  32.9 
 
 
373 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  37.64 
 
 
379 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  36.56 
 
 
365 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  26.95 
 
 
368 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  35.32 
 
 
376 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  36.31 
 
 
351 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  35.4 
 
 
391 aa  149  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  35.2 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  31.35 
 
 
376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  35.2 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>