More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2111 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
365 aa  731    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  60.8 
 
 
365 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  52.42 
 
 
360 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  52.71 
 
 
365 aa  359  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
363 aa  355  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  45.92 
 
 
368 aa  317  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  46.8 
 
 
366 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  47.08 
 
 
366 aa  309  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  47.37 
 
 
374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  47.35 
 
 
374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  47.09 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  45.29 
 
 
357 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 
356 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  45.45 
 
 
364 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
357 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  47.71 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  47.71 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  45 
 
 
357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  45 
 
 
357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  45 
 
 
357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  44.01 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  44.03 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
357 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 
356 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  44.86 
 
 
375 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
356 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  45 
 
 
356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  39.06 
 
 
358 aa  272  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  41.21 
 
 
365 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  41.4 
 
 
370 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  41.18 
 
 
368 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  40.32 
 
 
369 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  41.5 
 
 
363 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  40.54 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  41.18 
 
 
368 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  40.22 
 
 
396 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
371 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  35.29 
 
 
356 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  37.15 
 
 
360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
358 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  32.08 
 
 
349 aa  207  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
357 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
355 aa  202  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  37.75 
 
 
369 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
370 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
357 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.65 
 
 
373 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
357 aa  192  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
350 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 
365 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 
355 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.88 
 
 
349 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.74 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  31.87 
 
 
350 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  37.75 
 
 
363 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
351 aa  179  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  32.21 
 
 
355 aa  179  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  35.89 
 
 
369 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
364 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
348 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  32.28 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 
351 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.84 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  32.86 
 
 
360 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
380 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 
361 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
355 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  36.03 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  28.81 
 
 
358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 
357 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
365 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  34.99 
 
 
374 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 
354 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  35.51 
 
 
386 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  34.15 
 
 
353 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  29.11 
 
 
371 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  29.53 
 
 
371 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 
364 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  38.26 
 
 
360 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  34.49 
 
 
377 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  35.62 
 
 
351 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
356 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 
352 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 
369 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  36.58 
 
 
406 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  38.56 
 
 
397 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>