More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0344 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  94.4 
 
 		 357 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  91.86 
 
 		 364 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  93.28 
 
 		 357 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  99.44 
 
 		 357 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  94.96 
 
 		 357 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 357 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  94.96 
 
 		 357 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  86.63 
 
 		 356 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  86.05 
 
 		 356 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  85.76 
 
 		 356 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  86.05 
 
 		 356 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  86.05 
 
 		 356 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  86.05 
 
 		 356 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  83.1 
 
 		 356 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  86.05 
 
 		 356 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  86.05 
 
 		 356 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  81.41 
 
 		 356 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  81.13 
 
 		 356 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  65.92 
 
 		 366 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  68.27 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  66.2 
 
 		 366 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  68.48 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  66.76 
 
 		 374 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  58.33 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  55.17 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  56.21 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  56.25 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  54.06 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  56.52 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  54.13 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  53.2 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  55.43 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  54.05 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  54.7 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  54.32 
 
 		 374 aa  352  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  47.75 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  52.23 
 
 		 365 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  47.26 
 
 		 360 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  49 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  49 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  44.96 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  35.24 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  35.35 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  35.55 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.19 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  36.18 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  38.01 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  37.88 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  36.78 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  33.54 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  34.04 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  33.9 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 351 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  39.48 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  37.39 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.41 
 
 		 371 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  36.14 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  37.07 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  33.82 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  36.75 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.64 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  27.87 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  34.49 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  39.4 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  35.84 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  37.13 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  35.29 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  37.61 
 
 		 369 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  32.13 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  32.13 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  37.61 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.53 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>