More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1167 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 352 aa  712    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  68.47 
 
 		 352 aa  490  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  63.56 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4103  histidinol phosphate aminotransferase  61.01 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  59.82 
 
 		 347 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4253  aminotransferase class I and II  59.94 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  48.84 
 
 		 363 aa  322  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  31.99 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  29.74 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.3 
 
 		 358 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  32.07 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.23 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  31.74 
 
 		 348 aa  165  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  33.9 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  31.9 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  31.99 
 
 		 358 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  29.23 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  34.43 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.53 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 		 357 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  31.05 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  29.82 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 356 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  30.68 
 
 		 351 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 		 357 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  29.33 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  31.94 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  28.41 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  30.33 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  30.64 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  31.4 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  31.19 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  31.19 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  26.59 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  31.19 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  31.41 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.43 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  30.99 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  30.81 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 		 359 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  27.11 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 		 359 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 		 359 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 		 359 aa  142  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  30.18 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  26.9 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  30.43 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  27.7 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  29.78 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  30.2 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>