More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1156 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
355 aa  722    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  73.55 
 
 
363 aa  532  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  71.83 
 
 
355 aa  524  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  71.67 
 
 
360 aa  518  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  68.93 
 
 
357 aa  511  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  66.1 
 
 
357 aa  491  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  66.38 
 
 
365 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  37.75 
 
 
369 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  36.22 
 
 
363 aa  219  7.999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
371 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  33.03 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.91 
 
 
351 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 
357 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 
351 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  34.76 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 
358 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  30.9 
 
 
360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  34.15 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.3 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
355 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  32.21 
 
 
365 aa  179  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
368 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  34.45 
 
 
363 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  32.08 
 
 
371 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
356 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
356 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
356 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
357 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
356 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
356 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
356 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.65 
 
 
355 aa  175  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  33.75 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  33.75 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  33.75 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  33.75 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  33.75 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  33.83 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  29.33 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  33.75 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
356 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
374 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 
357 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 
364 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
353 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  32.81 
 
 
356 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  32.81 
 
 
357 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
382 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  30.36 
 
 
366 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 
365 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
382 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 
375 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  34.3 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 
357 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 
357 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
382 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  31.98 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  32.89 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  32.81 
 
 
357 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  32.72 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  31.09 
 
 
348 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
346 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 
346 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 
374 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  29.25 
 
 
357 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  30.34 
 
 
364 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.6 
 
 
370 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
365 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
365 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
362 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
374 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 
374 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 
357 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  31.72 
 
 
366 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  32.07 
 
 
356 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 
368 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 
356 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
359 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
374 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
359 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
365 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.81 
 
 
362 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  30.98 
 
 
351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 
364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  28.76 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>