More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1167 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 363 aa  732    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  76 
 
 		 365 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  74.1 
 
 		 358 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  73.14 
 
 		 371 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  69.54 
 
 		 369 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  68.21 
 
 		 368 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  68.01 
 
 		 370 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  67.6 
 
 		 375 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  68.21 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  65.49 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  63.64 
 
 		 374 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  59.27 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  57.87 
 
 		 366 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  56.5 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  55.65 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  56.21 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  58.6 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  57.73 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  58.02 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  57.73 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  57.73 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  58.6 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  58.02 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  57.73 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  57.73 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  55.39 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  58.02 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  56.85 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  58.02 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  57.73 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  56.25 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  54.59 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  55.98 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  54.32 
 
 		 374 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  46.78 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  47.44 
 
 		 363 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  46.57 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  46.18 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  46.7 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  46.7 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  45.03 
 
 		 365 aa  282  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  41.5 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  35.9 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.81 
 
 		 358 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  37.12 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.95 
 
 		 358 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  36.61 
 
 		 373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  34.74 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  33.72 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  32.85 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  33.81 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  30.54 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.46 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  34.85 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  32.76 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  29.27 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.93 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.65 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  31.83 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  28.46 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  28.73 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  32 
 
 		 382 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.86 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 347 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  30.08 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  33.87 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4103  histidinol phosphate aminotransferase  33.63 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4253  aminotransferase class I and II  33.13 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 		 362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 		 365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  29.19 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  30.26 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  33.51 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  29.33 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>