More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2883 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  100 
 
 		 358 aa  727    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  50.7 
 
 		 358 aa  394  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  40.85 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  38.87 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 		 355 aa  265  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  35.92 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 360 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  37.31 
 
 		 370 aa  222  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  36.74 
 
 		 363 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.99 
 
 		 356 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  34.74 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  34.01 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  32.03 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 349 aa  194  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  32.39 
 
 		 350 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 		 363 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  34.6 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  34.6 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  34.6 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 		 352 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 		 362 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 		 366 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  34.31 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  34.4 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.21 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  32.36 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  31.92 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  32.48 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.08 
 
 		 373 aa  185  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  34.5 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  34.42 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  31.49 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.54 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  32.27 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  33.51 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 348 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.3 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  30.7 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  30.81 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.14 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 		 369 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>