More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0667 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
369 aa  731    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
357 aa  255  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  40.35 
 
 
357 aa  255  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  38.9 
 
 
355 aa  249  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  39.77 
 
 
365 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  37.75 
 
 
355 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  39.53 
 
 
363 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  39.31 
 
 
360 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  36.96 
 
 
371 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  38.57 
 
 
360 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  34.75 
 
 
357 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  37.75 
 
 
365 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  35.1 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  35.82 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  38.32 
 
 
363 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 
365 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  38.83 
 
 
371 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 
363 aa  192  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 
356 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  37.24 
 
 
356 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  36.45 
 
 
356 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 
366 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  38.79 
 
 
363 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  38.6 
 
 
357 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  38.96 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  36.56 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  31.87 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 
363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 
374 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  34.89 
 
 
359 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  34.89 
 
 
359 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 
360 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 
365 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 
362 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  36.01 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 
366 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  37.65 
 
 
364 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 
358 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
386 aa  179  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  37.58 
 
 
356 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  37.69 
 
 
357 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  35 
 
 
375 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  37.27 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  37.27 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
358 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  37.27 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  37.27 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  37.69 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  37.27 
 
 
356 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  37.27 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
360 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  36.16 
 
 
368 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.48 
 
 
356 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.92 
 
 
358 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  38.04 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  38.3 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  38.3 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
356 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  36.17 
 
 
370 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  32.29 
 
 
372 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  37.69 
 
 
357 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
377 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  36.23 
 
 
352 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  28.69 
 
 
371 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
368 aa  166  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  35.95 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  30.51 
 
 
348 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
365 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 
453 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 
365 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.92 
 
 
355 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  35.56 
 
 
374 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
370 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.03 
 
 
369 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  31.47 
 
 
375 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
389 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  36.81 
 
 
344 aa  160  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  35.85 
 
 
361 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 
406 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
386 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 
362 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 
370 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 
370 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 
370 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 
370 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  28.18 
 
 
371 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  27.9 
 
 
371 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 
370 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 
370 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
370 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
373 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  34.97 
 
 
383 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  27.98 
 
 
371 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>