More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3042 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
359 aa  718    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
359 aa  718    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  50.83 
 
 
363 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  52.42 
 
 
365 aa  338  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  48.15 
 
 
368 aa  333  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  49.59 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 
356 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  51.14 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 
366 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  48.58 
 
 
356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  47.73 
 
 
356 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  48.97 
 
 
357 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  48.39 
 
 
357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  49.27 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  47.98 
 
 
364 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  49.27 
 
 
357 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  48.97 
 
 
356 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  46.7 
 
 
363 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  48.68 
 
 
356 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  48.68 
 
 
356 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  48.68 
 
 
356 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  48.68 
 
 
356 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  48.68 
 
 
356 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  48.68 
 
 
356 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  49.29 
 
 
374 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
374 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  48.97 
 
 
357 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  48.97 
 
 
357 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  48.99 
 
 
375 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
374 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  47.71 
 
 
365 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  47.29 
 
 
358 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  48.97 
 
 
357 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  46.92 
 
 
370 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  45.74 
 
 
371 aa  288  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  45.13 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  45.26 
 
 
369 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  45.51 
 
 
368 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  45.79 
 
 
368 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 
374 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  44.29 
 
 
396 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
360 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  36.08 
 
 
371 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  37.13 
 
 
370 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  39.2 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  38.26 
 
 
360 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  34.5 
 
 
356 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  39.63 
 
 
364 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  35.35 
 
 
350 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
369 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
351 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 
374 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.93 
 
 
358 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  37.03 
 
 
375 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 
356 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.08 
 
 
358 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
362 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.59 
 
 
373 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 
352 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
374 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  34.36 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  38.56 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  34.97 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
357 aa  173  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 
357 aa  173  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  30.68 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  35.21 
 
 
366 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  34.69 
 
 
387 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
369 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.46 
 
 
363 aa  169  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  31.21 
 
 
363 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 
365 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  35.86 
 
 
363 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
355 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  35.13 
 
 
370 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2316  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 
374 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  33.79 
 
 
377 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  31.65 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  34.23 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.96 
 
 
370 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.57 
 
 
368 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 
357 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
358 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
376 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
348 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
355 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
348 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  37.05 
 
 
366 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
369 aa  159  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
348 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
363 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
379 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.6 
 
 
373 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>