More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0200 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  89.73 
 
 
370 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
371 aa  736    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  59.89 
 
 
364 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  54.38 
 
 
369 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  44.75 
 
 
370 aa  319  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119523  Histidinol-phosphate aminotransferase, chloroplast precursor, probable  46.72 
 
 
409 aa  309  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  42.32 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  45.67 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  40.97 
 
 
358 aa  295  7e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  41.02 
 
 
355 aa  243  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  38.32 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  36.59 
 
 
371 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  37.9 
 
 
351 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  36.41 
 
 
357 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
386 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  39.46 
 
 
355 aa  215  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  38.9 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  36.27 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  38.81 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  34.91 
 
 
383 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  38.13 
 
 
362 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  35.44 
 
 
358 aa  208  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
363 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  36.02 
 
 
368 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  34.5 
 
 
358 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
366 aa  202  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
387 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  31.38 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  38.6 
 
 
373 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.85 
 
 
350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  35.92 
 
 
374 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  38.77 
 
 
365 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  40.27 
 
 
368 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  34.96 
 
 
360 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 
357 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  40.33 
 
 
358 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  35.82 
 
 
348 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  37.87 
 
 
363 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.52 
 
 
370 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  35.82 
 
 
348 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  33.79 
 
 
355 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  38.58 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.78 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
370 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
349 aa  190  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  40.78 
 
 
371 aa  190  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  33.69 
 
 
350 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
360 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  31.12 
 
 
371 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 
351 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 
370 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 
370 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  33.69 
 
 
350 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 
370 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  30.13 
 
 
371 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.07 
 
 
386 aa  189  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
348 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  34.14 
 
 
351 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  34.51 
 
 
350 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 
370 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 
370 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
351 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  37.19 
 
 
357 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  35.15 
 
 
365 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  36.12 
 
 
371 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 
357 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 
365 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  36.76 
 
 
353 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  36.76 
 
 
357 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 
351 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  35.87 
 
 
388 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  35.6 
 
 
365 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  39.78 
 
 
384 aa  186  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  30.32 
 
 
371 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  32.16 
 
 
366 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 
365 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.48 
 
 
363 aa  185  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  38.02 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  37.74 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  36.07 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
362 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
366 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
366 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
366 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 
356 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 
353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  37.47 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  29.26 
 
 
371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 
373 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  33.99 
 
 
369 aa  182  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  38.01 
 
 
371 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
354 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 
370 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
359 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
356 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>