More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3123 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 351 aa  704    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  70.66 
 
 		 353 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  70.09 
 
 		 353 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  67.24 
 
 		 352 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  64.2 
 
 		 354 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  61.82 
 
 		 353 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  61.54 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  61.25 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  60.81 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  61.1 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  60.81 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  61.69 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  60.73 
 
 		 355 aa  431  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  60.97 
 
 		 357 aa  428  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  62.68 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  60.45 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  60.23 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  59.43 
 
 		 350 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  59.43 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  59.71 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  60.81 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  60.56 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  59.04 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  61.36 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  59.32 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  59.94 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  60.52 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 		 356 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  60.97 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  60.06 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  58.77 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  56.78 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  59.6 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  57.06 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  58.79 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  58.47 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  58.15 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  58.94 
 
 		 363 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  54.08 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  54.57 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  55.03 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  55.03 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  49.29 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  51 
 
 		 351 aa  364  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  47.86 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  45.74 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  44.96 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  43.55 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  41.71 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  40.59 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  38.81 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.8 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.8 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  40.67 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  37.8 
 
 		 354 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  38.78 
 
 		 347 aa  215  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  37.28 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  38.22 
 
 		 350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  39.36 
 
 		 350 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  38.98 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  38.78 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  39.07 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  38.61 
 
 		 358 aa  198  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.84 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  35.62 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  32.28 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  31.99 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 		 365 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.32 
 
 		 358 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  35.23 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.3 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  34.96 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 		 374 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>