More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2430 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
382 aa  784    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  99.74 
 
 
382 aa  783    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  98.17 
 
 
382 aa  769    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  79.55 
 
 
362 aa  594  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  75.77 
 
 
357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  76.7 
 
 
356 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  75.49 
 
 
357 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  76.7 
 
 
356 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  74.58 
 
 
359 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  74.58 
 
 
359 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  74.58 
 
 
359 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  74.58 
 
 
359 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  74.35 
 
 
356 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  74.35 
 
 
356 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  74.35 
 
 
356 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  74.35 
 
 
356 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  74.01 
 
 
359 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  74.06 
 
 
356 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  74.06 
 
 
356 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  74.06 
 
 
356 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  74.06 
 
 
356 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  74.06 
 
 
356 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  72.33 
 
 
353 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  62.39 
 
 
360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  62.76 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  60.7 
 
 
346 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  59.82 
 
 
346 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  58.36 
 
 
346 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  52.68 
 
 
356 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  51.69 
 
 
371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  50.15 
 
 
359 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  47.99 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 
406 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 
352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  47.41 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  43.36 
 
 
368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  45.82 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 
349 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 
399 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 
399 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  44.61 
 
 
348 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  44.16 
 
 
399 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  43.87 
 
 
386 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  44.32 
 
 
356 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  44.7 
 
 
360 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  42.18 
 
 
365 aa  279  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  42.18 
 
 
365 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
351 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 
354 aa  272  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  39.23 
 
 
374 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  40.67 
 
 
355 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  38.53 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  44.29 
 
 
362 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  37.01 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  36.23 
 
 
348 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  37.54 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
402 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  37.82 
 
 
447 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  32.22 
 
 
410 aa  192  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
370 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.42 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.04 
 
 
364 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  31.15 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
357 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  36.41 
 
 
369 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.89 
 
 
351 aa  176  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.01 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.62 
 
 
358 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
365 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
355 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 
363 aa  162  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.45 
 
 
370 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
386 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  28.23 
 
 
368 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
401 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 
352 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
355 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
357 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
356 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 
360 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
371 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  30.25 
 
 
356 aa  156  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.28 
 
 
360 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  28.24 
 
 
357 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.99 
 
 
364 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  30.97 
 
 
350 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
371 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  33.55 
 
 
360 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
363 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
366 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
356 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119523  Histidinol-phosphate aminotransferase, chloroplast precursor, probable  33.53 
 
 
409 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 
365 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>