More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2179 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  87.9 
 
 		 391 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  95.57 
 
 		 396 aa  772    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 406 aa  817    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  93.43 
 
 		 401 aa  761    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  85.84 
 
 		 373 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  81.16 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  82.07 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  81.79 
 
 		 386 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  81.23 
 
 		 399 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  72.75 
 
 		 349 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  72.78 
 
 		 352 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  67.32 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  67.23 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  65.46 
 
 		 351 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  63.91 
 
 		 360 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  58.31 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  50.86 
 
 		 346 aa  332  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 		 346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  48.87 
 
 		 346 aa  326  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  47.58 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  47.88 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  47.71 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 		 356 aa  312  5.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 		 382 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 		 382 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  46.91 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  46.48 
 
 		 356 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  47.98 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  46.48 
 
 		 356 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  47.7 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  46.48 
 
 		 356 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  46.59 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  45.05 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  44.78 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  44.78 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  44.78 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  44.51 
 
 		 359 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  46.04 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  46.42 
 
 		 360 aa  269  7e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  40.92 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  42.12 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  39.61 
 
 		 365 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  39.55 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  32.76 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 		 351 aa  186  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  38.85 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  34.89 
 
 		 351 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  32.75 
 
 		 348 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.19 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  34.74 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  37.15 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  34.22 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  28.88 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  28.73 
 
 		 373 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.81 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.06 
 
 		 367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 		 362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  30.34 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.08 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  30.5 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  31.1 
 
 		 358 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.52 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2525  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.017315  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  34.13 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  31.31 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  33.03 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  31.35 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  31.87 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  27.1 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  31.12 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>