More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2229 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
356 aa  725    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  84.83 
 
 
356 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  79.15 
 
 
357 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  77.75 
 
 
357 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  76.7 
 
 
382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  76.7 
 
 
382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  76.06 
 
 
362 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  76.57 
 
 
382 aa  557  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  70.86 
 
 
356 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  70.86 
 
 
356 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  70.86 
 
 
356 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  70.57 
 
 
359 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  70.86 
 
 
356 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  70.29 
 
 
356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  70.57 
 
 
359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  70.57 
 
 
359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  70.29 
 
 
353 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  70.57 
 
 
359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  70.29 
 
 
359 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  70.57 
 
 
356 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  70.29 
 
 
356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  70 
 
 
356 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  70 
 
 
356 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  63.66 
 
 
360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  61.81 
 
 
346 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  60.81 
 
 
346 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  60.93 
 
 
346 aa  435  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  60.93 
 
 
346 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  52.54 
 
 
356 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  51.02 
 
 
359 aa  349  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  51.42 
 
 
371 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  47.88 
 
 
401 aa  316  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  46.35 
 
 
399 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  47.88 
 
 
406 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  46.35 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  47.59 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  46.07 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  46.74 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  47.59 
 
 
396 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  45.79 
 
 
386 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  48.12 
 
 
352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  48.25 
 
 
349 aa  309  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  44.64 
 
 
348 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  45.51 
 
 
356 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  46.46 
 
 
360 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  44.22 
 
 
351 aa  291  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  42.55 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  41.39 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  41.39 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  42.45 
 
 
354 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  41.86 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  40.28 
 
 
355 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 
357 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  38.6 
 
 
351 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 
362 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  37.04 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 
349 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
351 aa  230  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  34.27 
 
 
410 aa  218  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  37.57 
 
 
373 aa  212  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  38.4 
 
 
402 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  34.32 
 
 
447 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 
344 aa  194  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  33.24 
 
 
364 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  38.57 
 
 
370 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.43 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.81 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
357 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
371 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.66 
 
 
358 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  31.95 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  35.16 
 
 
355 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 
357 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 
355 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.07 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
356 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  33.66 
 
 
363 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.15 
 
 
360 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.44 
 
 
373 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 
371 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
369 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  28.9 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  30.16 
 
 
363 aa  146  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  30.33 
 
 
362 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  31.25 
 
 
362 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  31 
 
 
362 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  30.85 
 
 
360 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
364 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
355 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  30.62 
 
 
350 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  26.17 
 
 
371 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 
349 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  29.7 
 
 
385 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
374 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>