More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2180 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  87.98 
 
 		 399 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  90.74 
 
 		 386 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  87.72 
 
 		 399 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 373 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  87.98 
 
 		 399 aa  685    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  85.84 
 
 		 406 aa  627  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  84.76 
 
 		 401 aa  629  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  82.93 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  84.42 
 
 		 391 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  70.2 
 
 		 352 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  69.45 
 
 		 349 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  66.1 
 
 		 351 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  67.44 
 
 		 356 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  64.95 
 
 		 360 aa  471  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  64.66 
 
 		 348 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  56.53 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  48.43 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  48.29 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  49 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  47.71 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  47.16 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  46.74 
 
 		 356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  47.4 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  46.59 
 
 		 357 aa  308  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  45.82 
 
 		 382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  45.82 
 
 		 382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  46.11 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  45.53 
 
 		 353 aa  302  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  45.53 
 
 		 362 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  44.44 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  43.91 
 
 		 356 aa  292  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  43.91 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  43.63 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  43.63 
 
 		 356 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  43.63 
 
 		 356 aa  289  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  43.63 
 
 		 356 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  43.34 
 
 		 356 aa  288  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  43.34 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  43.34 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  42.78 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  42.78 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  44.63 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  42.78 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  42.49 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  44.58 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  40.05 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  38.9 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  39.15 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  40.4 
 
 		 364 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  31.07 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.66 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  31.56 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  33.25 
 
 		 410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  36.97 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  35.64 
 
 		 402 aa  156  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.59 
 
 		 358 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  36.4 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  32.7 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.06 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.98 
 
 		 351 aa  135  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  27.78 
 
 		 358 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 		 364 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  30 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  29.09 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  28.46 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  27.78 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  27.98 
 
 		 373 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  27.15 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  29.26 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.55 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  28.88 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  34.4 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  27.3 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  28.77 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  30.37 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  33.55 
 
 		 360 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>