More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1479 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 362 aa  728    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  69.55 
 
 		 370 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  67.42 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  61.93 
 
 		 353 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  63.46 
 
 		 353 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  61.65 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  60.4 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  59.54 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  59.38 
 
 		 352 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  61.36 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  58.15 
 
 		 356 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  59.27 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  61.03 
 
 		 351 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  59.77 
 
 		 348 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  59.27 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  58.33 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  58.99 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  58.62 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  58.71 
 
 		 356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  55.21 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  56.62 
 
 		 357 aa  401  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  59.83 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  58.71 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  57.76 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  60.17 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  55.08 
 
 		 353 aa  401  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  56.82 
 
 		 357 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  58.71 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  58.43 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  58.71 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  58.71 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  58.43 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  57.76 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  57.87 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  56.53 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  58.87 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  56.18 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  56.18 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  56.74 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  58.43 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  57.3 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  55.34 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  58.12 
 
 		 351 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  57.3 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  57.75 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  55.15 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  53.95 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  56.66 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  52.42 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  53.2 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  48.44 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  52.96 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  47.32 
 
 		 355 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  50.55 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  50.27 
 
 		 377 aa  348  6e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  45.87 
 
 		 356 aa  338  7e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  42.21 
 
 		 354 aa  334  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  42.61 
 
 		 355 aa  329  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  44.44 
 
 		 349 aa  315  8e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  42.86 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  42.29 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  41.76 
 
 		 350 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  41.21 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  42.36 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  38.53 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  38.35 
 
 		 350 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  39.71 
 
 		 350 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  40.63 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  40.63 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  40.35 
 
 		 354 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  39.55 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 		 358 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  37.15 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  35.18 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  34.5 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  35.29 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  33.96 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 		 365 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  35.66 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  35.31 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 		 362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.28 
 
 		 371 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  35.95 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 		 370 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>