More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  100 
 
 
356 aa  729    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  41.88 
 
 
353 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
355 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  43.97 
 
 
353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  43.65 
 
 
369 aa  311  7.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 
354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  43.66 
 
 
357 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  42.69 
 
 
350 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  44.38 
 
 
370 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  43.43 
 
 
352 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  44.76 
 
 
351 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  42.29 
 
 
353 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  44.07 
 
 
356 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  41.81 
 
 
355 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  42.9 
 
 
348 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  37.32 
 
 
355 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
353 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
362 aa  291  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  42.61 
 
 
348 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  45.22 
 
 
351 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  42.45 
 
 
354 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  42.41 
 
 
350 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  44.25 
 
 
363 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  42.61 
 
 
348 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  41.47 
 
 
356 aa  289  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  45.06 
 
 
355 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  45.06 
 
 
356 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  45.06 
 
 
355 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  41.23 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  43.19 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  41.81 
 
 
357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  43.77 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  44.54 
 
 
371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  40.97 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  41.71 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 
351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  42.82 
 
 
355 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  44.9 
 
 
355 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  44.19 
 
 
355 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  43.77 
 
 
359 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  42.73 
 
 
348 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  43.15 
 
 
357 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  44.38 
 
 
355 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  40.74 
 
 
353 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  42.61 
 
 
359 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  44.38 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  40.54 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  43.6 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  43.31 
 
 
355 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  44.06 
 
 
355 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  40.94 
 
 
356 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  42.58 
 
 
357 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  42.3 
 
 
357 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  43.19 
 
 
356 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  42.3 
 
 
357 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  42.3 
 
 
357 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  42.3 
 
 
357 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  43.06 
 
 
356 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  38.72 
 
 
377 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  38.67 
 
 
377 aa  255  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  36.26 
 
 
350 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  34.2 
 
 
365 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 
350 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 
350 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
358 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  33.14 
 
 
350 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 
348 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  32.14 
 
 
348 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
350 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  34.21 
 
 
347 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 
350 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  34.45 
 
 
350 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 
354 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 
347 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.03 
 
 
351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 
370 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  28.93 
 
 
358 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
371 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
358 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  35.76 
 
 
344 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  31.98 
 
 
365 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
365 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
358 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 
369 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  32.8 
 
 
369 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  35.13 
 
 
386 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  34.79 
 
 
368 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.29 
 
 
360 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  31.62 
 
 
365 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.01 
 
 
370 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  35.13 
 
 
362 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
369 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
355 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  31.08 
 
 
365 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  30.92 
 
 
355 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  33.92 
 
 
362 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 
369 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>