More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4286 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
347 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  75.22 
 
 
347 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  74.93 
 
 
350 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  72.29 
 
 
350 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  74.35 
 
 
350 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  73.43 
 
 
350 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  71.14 
 
 
350 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  68.86 
 
 
350 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  41.62 
 
 
354 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  40.87 
 
 
350 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  41.74 
 
 
356 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  43.63 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  43.26 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  41.28 
 
 
364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  40.73 
 
 
365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  42.36 
 
 
362 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 
350 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 
355 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  38.78 
 
 
348 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  39.07 
 
 
348 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
348 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 
355 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 
355 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  39.31 
 
 
355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
355 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  39.07 
 
 
348 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 
371 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 
357 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  40.63 
 
 
353 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
353 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  38.78 
 
 
350 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  39.53 
 
 
357 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  39.13 
 
 
354 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  39.26 
 
 
369 aa  230  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
356 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
350 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 
355 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 
355 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
355 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 
357 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  37.79 
 
 
353 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
353 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 
356 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 
357 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 
355 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 
357 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  38.62 
 
 
351 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 
357 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  40.46 
 
 
363 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  40.51 
 
 
359 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  40.41 
 
 
355 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  36.63 
 
 
350 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
353 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
370 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  40.74 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  38.26 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  39.18 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  36.15 
 
 
355 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  39.36 
 
 
356 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  37.72 
 
 
351 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  36.93 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  37.28 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  37.76 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  37.03 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  37.13 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  34.39 
 
 
350 aa  212  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  36.93 
 
 
377 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  39.07 
 
 
351 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 
356 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
349 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.56 
 
 
351 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.76 
 
 
371 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  33.14 
 
 
356 aa  186  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
357 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.04 
 
 
355 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  35.63 
 
 
355 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  35.25 
 
 
386 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
362 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 
362 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  29.56 
 
 
372 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 
362 aa  169  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 
370 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  30.05 
 
 
371 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 
367 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
349 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  29.49 
 
 
358 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  29.23 
 
 
371 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  35.15 
 
 
367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  29.7 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 
360 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
351 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
365 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>