More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7238 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
355 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  62.68 
 
 
352 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  61.8 
 
 
357 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  60.8 
 
 
353 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  57.75 
 
 
355 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  60.92 
 
 
357 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
356 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
356 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  62.54 
 
 
356 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  58.69 
 
 
353 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  59.44 
 
 
355 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  57.1 
 
 
354 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
357 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
357 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
357 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
357 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  59.72 
 
 
357 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  60 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  60.97 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  56.21 
 
 
356 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  56.25 
 
 
357 aa  408  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  58.03 
 
 
371 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  55.62 
 
 
356 aa  408  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  58.31 
 
 
355 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  58.31 
 
 
355 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  57.46 
 
 
359 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  54 
 
 
350 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  56.9 
 
 
355 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  54 
 
 
353 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  53.43 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  56.39 
 
 
369 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  58.47 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  58.74 
 
 
356 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  56.9 
 
 
359 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  58.03 
 
 
355 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  58.03 
 
 
355 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  57.06 
 
 
351 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  56.2 
 
 
351 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 
351 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  54.89 
 
 
350 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  55.15 
 
 
363 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  56.78 
 
 
355 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  53.57 
 
 
348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  52 
 
 
350 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  56.62 
 
 
370 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  53.87 
 
 
348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  54.76 
 
 
348 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  53.57 
 
 
348 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  56.66 
 
 
362 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  47.86 
 
 
355 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  52.42 
 
 
351 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  51.7 
 
 
353 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  46.59 
 
 
353 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  50.99 
 
 
367 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  51.79 
 
 
377 aa  354  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  51.25 
 
 
377 aa  349  5e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  43.38 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  43.23 
 
 
356 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  40.96 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
349 aa  296  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  42.82 
 
 
356 aa  286  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  39.24 
 
 
350 aa  266  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  40.29 
 
 
350 aa  236  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 
350 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  38.01 
 
 
347 aa  225  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  40.35 
 
 
350 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
350 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  39.18 
 
 
347 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  41.14 
 
 
358 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  38.63 
 
 
358 aa  215  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  34.28 
 
 
350 aa  215  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  36.23 
 
 
350 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  36.52 
 
 
350 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  35.59 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  35.59 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  37.2 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  35.82 
 
 
365 aa  206  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  36.95 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
365 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 
365 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
365 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
365 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
365 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  36.77 
 
 
386 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
365 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  35.73 
 
 
365 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 
362 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 
357 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  34.55 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  39.43 
 
 
372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.01 
 
 
351 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 
369 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  34.51 
 
 
378 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
369 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
362 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 
366 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
369 aa  169  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
366 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>