More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2955 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 352 aa  714    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  68.38 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  68.09 
 
 		 353 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  67.24 
 
 		 351 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  64.67 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  63.22 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  61.36 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  61.14 
 
 		 350 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  61.14 
 
 		 350 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  62 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  60.52 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  60.85 
 
 		 357 aa  437  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  60.52 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  60.52 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  62.43 
 
 		 359 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  58.86 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  62.68 
 
 		 355 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  61.67 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  62.71 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  58.86 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  59.65 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  60.63 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  57.83 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  60.89 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  60.06 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  59.33 
 
 		 369 aa  421  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  58.47 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  59.6 
 
 		 355 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 		 355 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  57.63 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  56.13 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  62.2 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  57.06 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  57.91 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  57.06 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  56.78 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  59.38 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 		 355 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  58.19 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  59.6 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  52.86 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  52.11 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  52.12 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  48.86 
 
 		 355 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  50.14 
 
 		 377 aa  353  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 		 377 aa  353  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  45.85 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  44.67 
 
 		 356 aa  332  8e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  43.87 
 
 		 355 aa  325  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  41.76 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  43.43 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  39.37 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  38.39 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  39.06 
 
 		 358 aa  218  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.9 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.9 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  35.41 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  37.03 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 		 350 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  34.39 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  37.03 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  35.97 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  33.51 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 370 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  34.62 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.22 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.15 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  33.51 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.11 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  31.15 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  34.05 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  30.36 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  30.08 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>