More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0220 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
350 aa  715    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  97.71 
 
 
350 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  74.93 
 
 
347 aa  534  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  71.76 
 
 
347 aa  524  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  70 
 
 
350 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  69.71 
 
 
350 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  70.29 
 
 
350 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  65.71 
 
 
350 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  44.19 
 
 
350 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  40.75 
 
 
348 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  40.75 
 
 
348 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  40.91 
 
 
354 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  45.61 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 
356 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  42.34 
 
 
358 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  41.26 
 
 
355 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  41.48 
 
 
355 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  41.48 
 
 
355 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  39.88 
 
 
350 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  40.91 
 
 
355 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  40.4 
 
 
371 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  40.52 
 
 
348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  40.18 
 
 
348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
348 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  39.31 
 
 
353 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
355 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  40 
 
 
365 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  42.45 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  40.58 
 
 
353 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 
357 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
355 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  42.45 
 
 
355 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  41.91 
 
 
355 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  39.59 
 
 
348 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
356 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  40.63 
 
 
362 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  39.47 
 
 
364 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  41.31 
 
 
363 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  41.33 
 
 
355 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  39.53 
 
 
354 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
357 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
357 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
357 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  40.8 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  39.09 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  39.6 
 
 
355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  38.48 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  37.32 
 
 
350 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  41.24 
 
 
359 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  38.64 
 
 
357 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  39.48 
 
 
357 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
377 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  41.24 
 
 
359 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  39.42 
 
 
351 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
350 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  37.9 
 
 
353 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
377 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  39.12 
 
 
351 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
353 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
355 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 
352 aa  222  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  37.21 
 
 
367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
356 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  36.69 
 
 
350 aa  216  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
349 aa  215  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  38.73 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  37.97 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  39.36 
 
 
351 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
354 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 
351 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  35.45 
 
 
356 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
356 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 
349 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
362 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
351 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
357 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
383 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
365 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
370 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 
370 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
370 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
370 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
355 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
370 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  35.52 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.13 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
365 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.71 
 
 
370 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  30.34 
 
 
372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  32.13 
 
 
367 aa  166  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>