More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1852 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  90.61 
 
 
391 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  96.26 
 
 
396 aa  775    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  93.43 
 
 
406 aa  761    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
401 aa  808    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  84.76 
 
 
373 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  81.67 
 
 
399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  82.07 
 
 
399 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  81.79 
 
 
386 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  74.32 
 
 
399 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  72.46 
 
 
349 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  73.35 
 
 
352 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  67.51 
 
 
348 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  67.51 
 
 
356 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  66.1 
 
 
351 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  63.64 
 
 
360 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  57.78 
 
 
362 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 
346 aa  334  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  50.29 
 
 
346 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  48.87 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  47.29 
 
 
357 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  47.88 
 
 
356 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  47.43 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  46.78 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  47.99 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  47.99 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  48.28 
 
 
382 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  48.27 
 
 
362 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  46.91 
 
 
353 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  46.48 
 
 
356 aa  309  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  46.48 
 
 
356 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  46.48 
 
 
356 aa  309  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  46.48 
 
 
356 aa  308  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  46.2 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  46.48 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  46.2 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  46.2 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  46.13 
 
 
356 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  44.78 
 
 
359 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  44.51 
 
 
359 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  44.51 
 
 
359 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  44.51 
 
 
359 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  44.23 
 
 
359 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  44.41 
 
 
359 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  46.04 
 
 
371 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  46.73 
 
 
360 aa  271  2e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  40.65 
 
 
368 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  42.98 
 
 
364 aa  232  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  40.56 
 
 
365 aa  227  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  40.51 
 
 
365 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  39.61 
 
 
354 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 
374 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
357 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  39.86 
 
 
373 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
351 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
348 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.19 
 
 
355 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
349 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  35.05 
 
 
410 aa  166  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  35.18 
 
 
402 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.37 
 
 
344 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
358 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  38.34 
 
 
447 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 
351 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
370 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  33.69 
 
 
369 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
355 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  34.81 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.53 
 
 
371 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.46 
 
 
368 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.28 
 
 
401 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  27.78 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
367 aa  136  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  30.62 
 
 
362 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  35.71 
 
 
364 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.09 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 
362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33 
 
 
383 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  28.85 
 
 
373 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
357 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  35.71 
 
 
364 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  30.79 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  27.48 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  35.13 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  28.98 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  35.29 
 
 
364 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2525  histidinol-phosphate aminotransferase  27.83 
 
 
358 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.017315  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
371 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  32.57 
 
 
371 aa  125  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
374 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  34.86 
 
 
371 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 
379 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
370 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  27.25 
 
 
380 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>