More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1943 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 362 aa  730    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  60.34 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  58.15 
 
 		 356 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  57.85 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  58.64 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  57.93 
 
 		 348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  57.3 
 
 		 391 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  58.24 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  58.24 
 
 		 406 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  58.57 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  57.78 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  55.74 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  55.18 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  56.53 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  55.18 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  47.84 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  46.55 
 
 		 346 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  47.22 
 
 		 356 aa  288  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  47.54 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  46.09 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  45.36 
 
 		 371 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  44.86 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  44.29 
 
 		 382 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  45.01 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  44.29 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 		 356 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  44.89 
 
 		 357 aa  272  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  43.18 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  45.43 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  44.35 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  44.35 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  44.35 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  45.43 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  44.35 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  43.84 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  45.14 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  45.43 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  44.07 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  44.86 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  45.14 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  45.14 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  44.86 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  44.86 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  42.3 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  44.21 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  42.57 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  39.33 
 
 		 354 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  40.77 
 
 		 364 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 		 374 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.28 
 
 		 373 aa  183  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  31.41 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  29.66 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  37.81 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  32.69 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  35.68 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.79 
 
 		 370 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  34.36 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.22 
 
 		 364 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.22 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.98 
 
 		 366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  31.21 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  31.92 
 
 		 357 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  32.41 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 		 370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  40.97 
 
 		 447 aa  145  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.05 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  29.59 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  27.78 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  30.9 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  28.81 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  31.18 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  29.89 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  31.18 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  32.9 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  29.38 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>