More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1718 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 349 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  81.45 
 
 		 352 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  71.43 
 
 		 391 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  69.6 
 
 		 386 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  72.75 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  72.75 
 
 		 406 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  69.6 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  69.32 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  72.46 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  69.6 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  69.45 
 
 		 373 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  70.15 
 
 		 356 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  67.16 
 
 		 351 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  68.8 
 
 		 360 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  68.25 
 
 		 348 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  60.34 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  49.42 
 
 		 346 aa  325  9e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  47.97 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  48.41 
 
 		 353 aa  318  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  48.26 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  48.12 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  48.12 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  48.41 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  48.12 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  47.83 
 
 		 356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  47.38 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  47.83 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  47.54 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  47.54 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  47.25 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  46.96 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  47.25 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  48.25 
 
 		 356 aa  309  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  46.67 
 
 		 359 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  46.49 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  48.09 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  46.49 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  46.76 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  47.08 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  46.49 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  46.2 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  44.61 
 
 		 359 aa  281  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  45.54 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  41.14 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  38.79 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  38.79 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.01 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  34.09 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  34.38 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.96 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.91 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  30.97 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  32.14 
 
 		 410 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  34.22 
 
 		 447 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  29.35 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 		 371 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.85 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  30.27 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  28.21 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  30.62 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.57 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  31.29 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  28.28 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 		 335 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  28.34 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  27.89 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  30.36 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  30.55 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  30.09 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  29.46 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  29.83 
 
 		 350 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  27 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>