More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3891 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
368 aa  754    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  45.11 
 
 
356 aa  315  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  46.17 
 
 
359 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  46.41 
 
 
371 aa  309  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  44.26 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  44.26 
 
 
356 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  43.98 
 
 
359 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  44.54 
 
 
356 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  44.26 
 
 
356 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  44.26 
 
 
359 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  43.98 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  44.26 
 
 
356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  43.98 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  44.26 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  44.26 
 
 
356 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  44.26 
 
 
356 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 
356 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  44.26 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  43.63 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  43.36 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  43.36 
 
 
382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  43.21 
 
 
356 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 
357 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  42.66 
 
 
362 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  42.66 
 
 
357 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  43.14 
 
 
353 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  43.7 
 
 
346 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  42.55 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  41.74 
 
 
346 aa  279  5e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  42.58 
 
 
346 aa  279  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  42.58 
 
 
346 aa  278  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  43.14 
 
 
360 aa  278  1e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  40.92 
 
 
406 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  40.92 
 
 
396 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  40.65 
 
 
401 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  40.7 
 
 
391 aa  247  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  40.05 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
349 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  41.93 
 
 
352 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  39.31 
 
 
399 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  39.05 
 
 
386 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  39.05 
 
 
399 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  38.79 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  39.45 
 
 
348 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
351 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  38.04 
 
 
360 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  35.88 
 
 
354 aa  222  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.25 
 
 
348 aa  213  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
349 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 
364 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  31.79 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
357 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 
351 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  31.17 
 
 
373 aa  180  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  30.81 
 
 
374 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 
344 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
402 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  30.08 
 
 
410 aa  171  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.04 
 
 
364 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  32.04 
 
 
364 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.28 
 
 
351 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  28.68 
 
 
447 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.43 
 
 
401 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.35 
 
 
358 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 
370 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  32.89 
 
 
369 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
357 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.42 
 
 
371 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  30.67 
 
 
356 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  35 
 
 
364 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  27.87 
 
 
358 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.57 
 
 
356 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  30.08 
 
 
355 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
355 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  31.35 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.4 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  31.43 
 
 
371 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  30.57 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 
363 aa  139  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  29.81 
 
 
364 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
357 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
367 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  30.5 
 
 
352 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  29.77 
 
 
360 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
380 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29 
 
 
368 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  29.32 
 
 
357 aa  136  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
360 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 
371 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  31.17 
 
 
380 aa  135  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  29.03 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>