More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2199 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 360 aa  731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  70 
 
 		 356 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  67.54 
 
 		 348 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  68.8 
 
 		 349 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  64.95 
 
 		 373 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  68.7 
 
 		 352 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  65.1 
 
 		 386 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  65.37 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  64.54 
 
 		 396 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  64.82 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  64.82 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  63.91 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  63.64 
 
 		 401 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  63.36 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  62.39 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1943  histidinol-phosphate aminotransferase  58.64 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  46.02 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  45.45 
 
 		 357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  48.03 
 
 		 356 aa  305  7e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  47.56 
 
 		 346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  47.58 
 
 		 346 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  45.33 
 
 		 353 aa  299  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  46.7 
 
 		 346 aa  300  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  46.46 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  44.38 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  44.48 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  44.7 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  45.58 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  44.7 
 
 		 382 aa  293  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  45.3 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  45.01 
 
 		 356 aa  291  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  45.06 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  45.01 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  45.01 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  44.73 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  45.01 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  44.82 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  43.65 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  43.37 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  43.75 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  43.37 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  43.37 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  43.09 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  44.32 
 
 		 371 aa  281  9e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  38.04 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  42.2 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  36.1 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.91 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  37.61 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  35.02 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  31.46 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09680  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.033269  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.96 
 
 		 358 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  34.59 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.48 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  31.22 
 
 		 367 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 		 358 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  31.36 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  27.14 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  31.61 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  28.9 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  29.28 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  31.36 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  28.93 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  29.13 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  27.86 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  27.86 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  27.14 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  28.97 
 
 		 348 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  29.13 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.12 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  29.8 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  30.77 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  29.8 
 
 		 357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.03 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1768  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>