More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0302 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
355 aa  713    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  63.04 
 
 
363 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  62.5 
 
 
353 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  60.8 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  58.89 
 
 
358 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  58.89 
 
 
358 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  58.61 
 
 
358 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  60 
 
 
360 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  57.22 
 
 
355 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  61.16 
 
 
351 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  52.84 
 
 
370 aa  347  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  52.41 
 
 
359 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  52.3 
 
 
391 aa  342  7e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 
352 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  53.33 
 
 
356 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  54.52 
 
 
359 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 
360 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  50.82 
 
 
367 aa  328  8e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  54.21 
 
 
370 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  53.14 
 
 
359 aa  324  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  51.26 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  53.91 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  52.56 
 
 
372 aa  315  8e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  53.89 
 
 
356 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  50 
 
 
369 aa  302  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  44.54 
 
 
365 aa  300  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  49.28 
 
 
369 aa  299  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  52.17 
 
 
367 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  46.11 
 
 
372 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  48.59 
 
 
360 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  48.72 
 
 
357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  51.3 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  44.66 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  50.73 
 
 
356 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  47.19 
 
 
366 aa  279  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  44.26 
 
 
363 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  43.85 
 
 
365 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
373 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  40.17 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  41.11 
 
 
383 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.41 
 
 
364 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  41.62 
 
 
370 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  40.31 
 
 
362 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  39.77 
 
 
362 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  41.44 
 
 
370 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  42.99 
 
 
376 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  38.84 
 
 
386 aa  205  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
370 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  36.89 
 
 
358 aa  203  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  34.84 
 
 
372 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  39.58 
 
 
374 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  39.22 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  39.27 
 
 
369 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  41.1 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.4 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 
370 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  38.39 
 
 
370 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  40.55 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 
371 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  41.72 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  35.63 
 
 
374 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
369 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  40.42 
 
 
374 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
369 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  39.16 
 
 
371 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  39.45 
 
 
370 aa  195  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  39.7 
 
 
374 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  35.83 
 
 
370 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
352 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
352 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  35.96 
 
 
370 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  39.67 
 
 
365 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  35.96 
 
 
370 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  39.27 
 
 
370 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  35.96 
 
 
370 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 
370 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0726  histidinol phosphate aminotransferase  39.61 
 
 
351 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.96 
 
 
370 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  38.86 
 
 
374 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 
370 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  40.48 
 
 
374 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 
367 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  39.76 
 
 
362 aa  189  8e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
351 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  34.84 
 
 
370 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.05 
 
 
369 aa  188  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
366 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  37.43 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  37.43 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  36.87 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  37.43 
 
 
353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  41.72 
 
 
333 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  39.26 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  37.89 
 
 
369 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>