More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6316 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6316  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 370 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3575  histidinol-phosphate aminotransferase  60.61 
 
 		 374 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.522328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0154  histidinol-phosphate aminotransferase  43.87 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  34.52 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  35.56 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  38.81 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  34.45 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  39.72 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  38.1 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3654  aminotransferase class I and II  36.26 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.817087  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  38.5 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  33.96 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 370 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  39.18 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  34.44 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  37.85 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 		 370 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  38.8 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  35.73 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  36.15 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  39.11 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  32.79 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  34.41 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  38.23 
 
 		 376 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  37.16 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  33.69 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  31.46 
 
 		 370 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  35.1 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  35.1 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  36.14 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 		 380 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.03 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  35.6 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  36.13 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  36.64 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  29.89 
 
 		 366 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  31.77 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  35.29 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.89 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  29.61 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  30.67 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  35.87 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  35.1 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  29.4 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 368 aa  179  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  34.1 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  29.77 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.19 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  32.4 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 		 352 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 		 352 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  30.19 
 
 		 366 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  30.19 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  30.19 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.62 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0339  histidinol-phosphate aminotransferase  29.78 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>