22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1405 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0911  hypothetical protein  38.76 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0959  MarR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1831  transcriptional regulator, MarR family  23.94 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  26.4 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  25.28 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  25 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  29.81 
 
 		 170 aa  48.5  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  25.84 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  25.84 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 338 aa  45.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0714  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.05 
 
 		 495 aa  45.1  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00136687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 336 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7427  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2902  CoA-binding domain protein  39.58 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.586678  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.18 
 
 		 613 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 334 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  32.31 
 
 		 99 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  32.31 
 
 		 99 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2275  ArsR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 105 aa  41.6  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 334 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>