More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1468 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 113 aa  123  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  50.49 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  51.11 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  44 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  42.55 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  50.79 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.2 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  34.83 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  51.56 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  41.56 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  40 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  51.61 
 
 		 312 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2721  regulatory protein ArsR  36.26 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1504  transcriptional regulator, TrmB  46.43 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.18 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  32.95 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  32.95 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  31.52 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>