More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0938 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  213  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  61.7 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  51.55 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 120 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  49.49 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  52.87 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  48.35 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  45.78 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  43.9 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 317 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2815  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  34.83 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  28.16 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  30.53 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  30.53 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  32.53 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 227 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  36.26 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 341 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 312 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 341 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  34.67 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  37.63 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  34.52 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  34.67 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  32.5 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4510  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  32.93 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 307 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 310 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 305 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 339 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>